人人都想成为五大主力，人人也都想成为五大主力之首的新一军。但编制就这么多，五个军满员全编不过11万人，而太平军现有陆师37个镇，去除水份也有近三十万人，这意味着能够入编五大主力的部队不仅要是能打的精锐，更得是嫡系。
葛义过江后，拍着胸脯对周士相说，这五大主力的新一军不从他江北军中编组，那就是看不起他葛老六。
蒋和也从安庆屁颠屁颠的乘船赶到镇江，听说葛老六要抢新一军，二话不说就和他争了起来，天王老子劝也没用。
铁毅也从驻地常州赶了过来，如此一来，老四镇的四大镇将除了现在贵州主持西南军政的邵九公，三大巨头都已到齐。
在镇江的还有刚刚在松江平乱的苏纳和王辅臣等将领，他们无一不是可以独当一面的大将，除了资历不如老四镇的四大“巨头”，战功方面并不差他们多少，甚至还有过之。
一直以来，对军政大事不感兴趣，并且以呆在周士相身边当侍卫统领为荣的瞎子李不知道脑子怎的发起热来，也加入到了这五大主力的争抢之中。他和同样有心在五大主力分一杯羹的王辅臣结成了盟友，一块对抗老资历的葛老六和蒋秃子。
周士相懒得听这帮大将们在那诉忠心，倒苦功，这几天他让徐应元替他挡客，不管是谁一律不见，只在军部那里和郭雄等人商议五大主力的编组及余下各镇的改编。
最终，五大主力组成镇正式确定，并且又将现有37个镇区分为甲级镇、乙级镇、丙级镇。
甲级镇为一线野战军，乙级镇为二线支援军，丙级镇为地方军。
甲级镇下设三旅加镇直属炮兵、工兵、辎重部队；乙级镇同样下辖三旅，但没有炮兵和工兵，只有辎重部队；丙级镇下设两旅，无炮兵、工兵，亦无辎重部队。降此之外，甲级镇中必须有两到三个战斗英雄部队（团以下），并保留成军之初授予的军旗。乙丙二镇则无此要求。
初定全军甲级镇8个，乙级镇14个，丙级镇15个。为了区分，甲级镇为“整”字头，乙级镇为“新”字头，丙级镇为“暂”字头。如整一镇、新三镇、暂五镇等。
8个甲级镇中，有3个是纯火器镇，其中一个更是全镇装备了军械局刚刚才能大规模生产的燧发枪。其余五个，都是冷热兵器混合编成，乙丙镇则多半都是冷兵器为主。
新一军由原王辅臣的骑兵第一镇和现隶属江北军的齐豪第一镇组成，番号改为整编第一镇、新编第一镇。军部驻地暂为江苏淮安，军长由王辅臣出任，总镇由齐豪出任。
新二军由原苏纳第六镇和邵成国的骑兵第二镇组成，番号为整二镇、整三镇。军部驻地暂为扬州，军长由苏纳出任，总镇由邵成国出任。
新三军由李匡明的第五镇和江北军朱庆来的新二镇组成，番号为整四镇、新二镇。军部驻地暂为苏州，军长由李匡明出任，总镇为朱庆来。
新四军由原安徽巡抚蒋和的第三镇和尚可远的新三镇组成，番号为整五镇、新三镇。军部驻地安庆，军长由军部官郭雄出任，总镇为尚可远。
新五军由原西南野战军王有喜的第四镇和卢光祖的远征军第二镇组成，番号为整六镇、整七镇。军部驻地贵阳，军长王有喜，总镇卢光祖。
五大主力中，除新二军、新五军都是由两个甲级镇组成外，其余三个军都是一个甲级镇、一个乙级镇组成。
总共八个甲级镇，五大主力就占了七个，余下一个则是由李瞎子统领的周士相直属卫队和于世忠之子于佑明的火器旅改编而成，番号为整八镇。对这个结果，李瞎子还算满意，虽说没能当上一军之长，但也混了个甲级镇将，且还是大帅身边的近卫镇，算起来不比一军之长差。
原胡启立的第七镇、韩朝宗的第十七镇、王兴的第十镇、甘辉的第十六镇、耿仲德的第十四镇、郭登第的第九镇、蒋和在安徽新编的两镇（镇将为张勇和李本深）、浙江以清军降兵为主改编的两镇（镇江为裘德、鄂多）、广东宋襄公的两镇（镇江为原南阳总兵张超、原花县千户黄四成）都被定为乙级镇。余下各镇则一律定为丙级镇。
各部番号正式确定后，将从现在的驻地调防，军部初步估算，全部调防完毕最少需要半年时间，因此当前主要是五大主力的整编和调防。
军队调防不是接到命令就启程这么简单，还牵扯到家属安置，营地交接、防区整顿等琐事，并且需要调防的各镇大多是步兵为主，受交通道路限制，难以短期集结完毕。就如现驻扎在金厦的胡启立部要调防至安庆，上千里路程下来，光靠脚板底走，就够胡部喝一壶的了。
五大主力整编方案出台后，最高兴的人无疑就是葛老六了，因为他江北军的四个镇有三个被定为甲级镇，且新一军和新二军的驻地都在他江淮经略使的地盘，因此他得意洋洋，以为自己现在是兵强马壮，可以一下指挥两大主力。一众老兄弟中，哪个也没他这么露脸。不想高兴没到两天，军部新的方案又出台了，却是取消了现有各军团编制。
因为之前有过军团一级的编制，现在新建军一级编制，难免和军团这一级职能重合，导致指挥系统混乱。所以周士相决定将现有各军团编制一律裁撤，正式恢复大都督府这一洪武年间节制中外诸军事的机构。
当日从广州北伐时，周士相用的就是大都督的名义，只是却没有恢复大都督府，而是一直以齐王府和军部来执行大都督府的功能。现在重新恢复大都督府，将齐王府和军部的相关职司并入大都督府，也算是周士相对太平军军政体系的一次整合。
周士相本人出任大都督，下辖五军都督，即中军都督、前军都督、后军都督、左军都督、右军都督。